Passagererne i Brindisi Lufthavn betjenes af én terminal , der håndterer alle fly til alle destinationer.

Check-in-skrankerne ligger i stueetagen til højre, mens ankomsthallen ligger i stueetagen til højre. Sikkerhedskontrollen og transitområdet ligger på 1. sal med rulletrapper og elevatorer, der fører dertil.

Terminalen er meget lille og er ofte overfyldt i sommersæsonen med et minimum af siddepladser. Vær i lufthavnen helst 2 timer før afgang. Denne tid vil altid være tilstrækkelig.